自闭症谱系障碍新发现:启动子变异与基因组“邻里”的关联

来源:李尔逊 大脑认知功能 2024-02-25 11:22 黑龙江自闭症谱系障碍(ASD)的遗传学研究再次取得突破。最近,一项发表在《Cell Genomics》上的研究揭示了启动子变异如何通过基因组的三维结构——拓扑关联域(TADs)——影响ASD风险。这篇文章将为您解读这一科学进展,以及它对ASD研究和临床实践的潜在影响。

自闭症谱系障碍新发现:启动子变异与基因组“邻里”的关联插图

在自闭症谱系障碍的研究中,全基因组测序(WGS)已成为揭示遗传变异与疾病关联的重要工具。然而,大多数与ASD相关的启动子变异并不直接位于已知ASD基因的上游。这项由Takumi Nakamura等人进行的研究,通过分析5044名ASD患者、4095名未受影响的兄弟姐妹及其父母的WGS数据,发现了一个新的遗传风险因素。研究者们发现,位于包含ASD基因的TADs内的启动子de novo变异(DNVs)与ASD风险显著相关。TADs是基因组中的一种三维结构,它们允许基因组内特定区域之间的相互作用。这项研究通过将TADs作为功能单元进行分析,揭示了特定TADs中启动子DNVs的富集与ASD的关联,并指出这些区域的常见变异也参与了ASD的遗传传递。

自闭症谱系障碍新发现:启动子变异与基因组“邻里”的关联插图1

实验验证阶段,研究团队使用人类诱导多能干细胞(iPSCs)展示了ASD中可能有害的启动子DNVs如何影响同一TAD内的多个基因,导致ASD相关基因的整体失调。这一发现不仅为ASD的遗传学研究提供了新的视角,也为未来的诊断和治疗提供了新的线索。

结语:这项研究强调了基因组三维结构在ASD遗传风险中的重要性。通过理解TADs和基因调控机制,我们可能更接近于揭示ASD的复杂遗传架构。这对于开发更精确的诊断工具和更有效的治疗策略具有重要意义。随着研究的深入,我们期待为ASD患者及其家庭带来更好的支持和希望。

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【文献】

Takumi Nakamura, Junko Ueda, Shota Mizuno, Kurara Honda, An-a Kazuno, Hirona Yamamoto, Tomonori Hara, Atsushi Takata, Topologically associating domains define the impact of de novo promoter variants on autism spectrum disorder risk, Cell Genomics, Volume 4, Issue 2, 2024, 100488

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